Résumé La dysbiose du microbiome buccal a été associée à diverses maladies humaines locales et systémiques, telles que les caries dentaires, les maladies parodontales, l’obésité et les maladies cardiovasculaires. La composition bactérienne peut être affectée par l’âge, la santé bucco-dentaire, l’alimentation et la géographie, même si les informations manquent encore sur la variation naturelle observée dans le grand public. Dans cette étude, des scientifiques citoyens ont utilisé un modèle de crowdsourcing pour obtenir des données sur la composition bactérienne orale auprès des visiteurs du Denver Museum of Nature and Science afin de déterminer si les associations précédemment suspectées du microbiome oral avec la démographie, le mode de vie et/ou la génétique d’un individu sont robustes et suffisamment généralisable pour être détecté dans une population générale. Conformément à des recherches antérieures, nous avons constaté que la composition bactérienne est plus diversifiée dans les microbiomes juvéniles que chez les adultes. Les microbiomes buccaux des adultes étaient principalement affectés par les habitudes de santé bucco-dentaire, tandis que les microbiomes des jeunes étaient affectés par le sexe biologique et le statut pondéral. L’agent pathogène oral Treponema a été détecté plus fréquemment chez les adultes n’ayant pas consulté récemment chez le dentiste et chez les jeunes obèses. De plus, les microbiomes oraux des participants de la même famille étaient plus similaires que ceux d’individus non apparentés. Ces résultats suggèrent que les associations du microbiome oral précédemment signalées sont observables dans une population humaine qui présente des variations naturelles couramment trouvées dans le grand public. De plus, ces résultats soutiennent l’utilisation de données de crowdsourcing comme méthodologie valable pour obtenir des données communautaires sur le microbiome. |
Contexte et résultats
La plupart des gens savent qu’une bonne hygiène bucco-dentaire (brossage, utilisation de la soie dentaire et visites régulières chez le dentiste) est liée à une bonne santé. Les chercheurs en microbiome de l’Université d’État du Colorado proposent de nouvelles preuves à l’appui de cette idée reçue, en examinant de plus près les communautés invisibles de microbes qui vivent dans chaque bouche.
Le microbiome oral , la somme totale des micro-organismes, y compris les bactéries et les champignons, qui occupent la bouche humaine, a fait l’objet d’une étude scientifique participative menée par le laboratoire de recherche de Jessica Metcalf à la CSU et l’équipe de recherche de Nicole Garneau à Musée de la nature et des sciences de Denver. Publiée dans Scientific Reports , l’étude a révélé, entre autres, une corrélation entre les personnes qui ne se rendaient pas régulièrement chez le dentiste et une plus grande présence d’un agent pathogène responsable de la maladie parodontale.
Pour les expériences menées par l’équipe scientifique communautaire de Garneau au laboratoire de génétique du goût du musée, un large échantillon de visiteurs du musée ont subi un prélèvement de joue et ont répondu à des questions simples sur leurs données démographiques. , modes de vie et habitudes de santé.
Les données de séquençage de l’ADN microbien analysées par le groupe de Metcalf ont largement révélé que les habitudes de santé bucco-dentaire affectent les communautés bactériennes dans la bouche. L’étude a souligné la nécessité de considérer la santé bucco-dentaire comme étant étroitement liée à la santé de l’ensemble du corps.
"Notre étude a également montré que le crowdsourcing et le recours à des scientifiques communautaires peuvent être un très bon moyen d’obtenir ce type de données, sans avoir à recourir à de grandes études cas-témoins", a déclaré Zach Burcham, chercheur postdoctoral et auteur principal. de l’article. L’auteur principal Metcalf est professeur agrégé au Département des sciences animales et membre du réseau CSU Microbiome.
Écouvillonnages de joues
En 2015, Garneau, co-auteur de l’article, et son équipe ont formé des scientifiques citoyens bénévoles à utiliser de grands écouvillons pour prélever des cellules sur les joues des visiteurs du musée, une population naturellement diversifiée, qui ont consenti à l’étude. Ces scientifiques citoyens formés ont aidé à prélever des échantillons auprès de 366 personnes : 181 adultes et 185 jeunes âgés de 8 à 17 ans.
L’objectif initial de l’étude était de déterminer si et dans quelle mesure le microbiome oral contribue à la façon dont les gens goûtent les sucreries . En collectant ces données, qui ont également été rapportées dans l’article, les chercheurs ont découvert des points de données plus significatifs sur les habitudes en matière de santé bucco-dentaire.
Pour l’aider à traduire les données, Garneau s’est tourné vers l’équipe d’experts de Metcalf au CSU. Burcham et les scientifiques du microbiome ont utilisé des outils sophistiqués de séquençage et d’analyse pour déterminer quels microbes étaient présents dans quelles bouches. Les données de séquençage ont été réalisées en collaboration avec des scientifiques du groupe de Rob Knight de l’Université de Californie à San Diego. Une équipe de nutrition de l’Université de Michigan State a également apporté à l’analyse des données son expertise sur l’importance des relations entre nourrissons et mères.
« Ensemble, nous formions une équipe de rêve pour utiliser la science communautaire pour répondre à des questions complexes sur la santé humaine et la nutrition, en utilisant le séquençage et l’analyse microbiennes de nouvelle génération », a déclaré Garneau.
Fil dentaire et soins dentaires réguliers
L’étude a regroupé des personnes qui utilisaient ou non la soie dentaire (presque tout le monde a déclaré qu’elles se brossaient, ce n’était donc pas un point de données utile). Les participants qui utilisaient la soie dentaire présentaient une diversité microbienne dans la bouche inférieure à celle de ceux qui n’utilisaient pas la soie dentaire. Cela est probablement dû à l’ élimination physique des bactéries susceptibles de provoquer une inflammation ou une maladie.
Les adultes qui étaient allés chez le dentiste au cours des trois derniers mois présentaient une diversité microbienne globale plus faible dans la bouche que ceux qui n’y étaient pas allés depuis 12 mois ou plus, et ils présentaient moins de l’agent pathogène oral responsable de la maladie parodontale, Treponema . Encore une fois, cela était probablement dû au nettoyage dentaire qui éliminait les taxons bactériens les plus rares de la bouche. Les jeunes ont tendance à avoir eu une visite chez le dentiste plus récemment que les adultes.
Les microbiomes des jeunes différaient entre les hommes et les femmes, ainsi qu’en termes de poids. Les enfants considérés comme obèses sur la base de leur indice de masse corporelle présentaient des microbiomes distincts par rapport aux enfants non obèses. Les enfants obèses ont également tendance à présenter des taux plus élevés de tréponème, le même agent pathogène que l’on retrouve chez les adultes qui n’ont pas été chez le dentiste depuis plus d’un an. En d’autres termes, les chercheurs ont vu un lien possible entre l’obésité infantile et les maladies parodontales. "C’était très intéressant pour moi de pouvoir détecter ces données dans une population aussi générale, avec un groupe de personnes aussi variable", a déclaré Burcham.
Autres données découvertes : les microbiomes des participants les plus jeunes, principalement âgés de 8 à 9 ans, présentaient plus de diversité que ceux des adultes.
Cependant, les microbiomes adultes varient davantage d’une personne à l’autre. Les chercheurs pensent que cela est dû au fait que l’environnement et le régime alimentaire des adultes sont plus larges que ceux des enfants.
Ils ont également constaté que les personnes vivant dans le même foyer partageaient des microbiomes buccaux similaires .
"Quand vous regardez les familles qui vivent ensemble, vous constatez qu’elles partagent davantage de ces taxons rares, les bactéries que l’on ne trouve pas aussi souvent en abondance", a expliqué Burcham. Il s’agit d’un point de données qui a souligné la pertinence de l’environnement bâti par rapport aux communautés microbiennes de notre corps.
Travailler sur l’étude de la bouche était fascinant, bien que sortant du cadre habituel de Burcham ; En règle générale, il se concentre sur l’étude de l’écologie microbienne de la décomposition.
"Je pense que nos vies sont essentiellement régies par nos microbiomes et affectées par nos microbiomes. C’est intéressant, quel que soit le système que nous examinons", a déclaré Burcham.
