Riepilogo La disbiosi del microbioma orale è stata associata a varie malattie umane locali e sistemiche, come la carie dentale, la malattia parodontale, l’obesità e le malattie cardiovascolari. La composizione batterica può essere influenzata dall’età, dalla salute orale, dalla dieta e dalla geografia, sebbene manchino ancora informazioni sulla variazione naturale riscontrata nel pubblico in generale. In questo studio, gli scienziati cittadini hanno utilizzato un modello di crowdsourcing per ottenere dati sulla composizione batterica orale dai visitatori del Museo di Natura e Scienza di Denver per determinare se le associazioni del microbioma orale precedentemente sospettate con i dati demografici, lo stile di vita e/o la genetica di un individuo sono solide e sufficientemente generalizzabile da poter essere rilevato all’interno di una popolazione generale. Coerentemente con ricerche precedenti, abbiamo scoperto che la composizione batterica è più diversificata nei microbiomi giovanili rispetto a quelli adulti. I microbiomi orali degli adulti erano influenzati principalmente dalle abitudini di salute orale, mentre i microbiomi giovani erano influenzati dal sesso biologico e dallo stato di peso. L’agente patogeno orale Treponema è stato rilevato più frequentemente negli adulti senza visite recenti dal dentista e nei giovani obesi. Inoltre, i microbiomi orali dei partecipanti della stessa famiglia erano più simili tra loro rispetto ai microbiomi orali di individui non imparentati. Questi risultati suggeriscono che le associazioni del microbioma orale precedentemente riportate sono osservabili in una popolazione umana che contiene variazioni naturali comunemente riscontrate nel grande pubblico. Inoltre, questi risultati supportano l’uso dei dati di crowdsourcing come metodologia valida per ottenere dati sul microbioma basati sulla comunità. |
Contesto e risultati
La maggior parte delle persone sa che una buona igiene orale (spazzolatura, uso del filo interdentale e visite regolari dal dentista) è correlata alla buona salute. I ricercatori sul microbioma della Colorado State University offrono nuove prove a sostegno di questa saggezza convenzionale, dando uno sguardo più da vicino alle comunità invisibili di microbi che vivono in ogni bocca.
Il microbioma orale , la somma totale dei microrganismi, inclusi batteri e funghi, che occupano la bocca umana, è stato oggetto di uno studio condotto da citizen science in crowdsourcing da parte del laboratorio di ricerca di Jessica Metcalf presso la CSU e del team di ricerca di Nicole Garneau presso Museo della natura e della scienza di Denver. Pubblicato su Scientific Reports , lo studio ha rilevato, tra l’altro, una correlazione tra le persone che non si recavano regolarmente dal dentista e una maggiore presenza di un agente patogeno che causa la malattia parodontale.
Per gli esperimenti, condotti dal team scientifico della comunità di Garneau nel Laboratorio di Genetica del Gusto del museo, un ampio campione di visitatori del museo è stato sottoposto a un tampone sulla guancia e ha risposto a semplici domande sui loro dati demografici. , stili di vita e abitudini salutari.
I dati di sequenziamento del DNA microbico analizzati dal gruppo di Metcalf hanno rivelato ampiamente che le abitudini di salute orale influenzano le comunità batteriche nella bocca. Lo studio ha sottolineato la necessità di pensare alla salute orale come fortemente legata alla salute di tutto il corpo.
"Il nostro studio ha anche dimostrato che il crowdsourcing e l’utilizzo di scienziati della comunità possono essere un ottimo modo per ottenere questo tipo di dati, senza dover utilizzare studi ampi e controllati", ha affermato Zach Burcham, ricercatore post-dottorato e autore principale. dall’articolo. L’autore senior Metcalf è professore associato presso il Dipartimento di scienze animali e membro della CSU Microbiome Network.
Tamponi di guancia
Nel 2015, la coautrice dell’articolo Garneau e il suo team hanno addestrato scienziati cittadini volontari a utilizzare tamponi di grandi dimensioni per raccogliere cellule dalle guance dei visitatori del museo, una popolazione naturalmente diversificata, che ha acconsentito allo studio. Questi scienziati cittadini formati hanno contribuito a raccogliere tamponi da 366 persone: 181 adulti e 185 giovani di età compresa tra 8 e 17 anni.
Lo scopo originale dello studio era determinare se e in che misura il microbioma orale contribuisce al modo in cui le persone assaggiano i dolci . Raccogliendo questi dati, riportati anche nell’articolo, i ricercatori hanno individuato dati più significativi sulle abitudini di salute orale.
Per aiutare a tradurre i dati, Garneau si è rivolto al team di esperti di Metcalf presso la CSU. Gli scienziati di Burcham e del microbioma hanno utilizzato sofisticati strumenti di sequenziamento e analisi per determinare quali microbi erano presenti in quali bocche. I dati di sequenziamento sono stati elaborati in collaborazione con gli scienziati del gruppo di Rob Knight presso l’Università della California, a San Diego. Un team nutrizionale della Michigan State University ha apportato all’analisi dei dati anche la propria esperienza sull’importanza delle relazioni tra neonati e madre.
"Insieme, avevamo un dream team che utilizzava la scienza comunitaria per rispondere a domande complicate sulla salute umana e la nutrizione, utilizzando il sequenziamento e l’analisi microbica di prossima generazione", ha affermato Garneau.
Uso del filo interdentale e cure dentistiche regolari
Lo studio ha raggruppato persone che usavano o non usavano il filo interdentale (quasi tutti dicevano di lavarsi i denti, quindi questo non era un dato utile). È stato riscontrato che i partecipanti che usavano il filo interdentale avevano una diversità microbica in bocca inferiore rispetto a quelli che non lo usavano. Ciò è probabilmente dovuto alla rimozione fisica dei batteri che potrebbero causare infiammazioni o malattie.
Gli adulti che erano stati dal dentista negli ultimi tre mesi avevano una diversità microbica complessiva in bocca inferiore rispetto a quelli che non erano andati dal dentista per 12 mesi o più, e avevano meno del patogeno orale che causa la malattia parodontale, il Treponema . Ciò, ancora una volta, era probabilmente dovuto alla pulizia dentale che rimuoveva i taxa batterici più rari presenti nella bocca. I giovani tendevano ad aver effettuato una visita odontoiatrica più recentemente rispetto agli adulti.
I microbiomi giovanili differivano tra uomini e donne e in base al peso. I bambini considerati obesi in base ai loro indici di massa corporea avevano microbiomi distinti rispetto ai bambini non obesi. I bambini obesi tendono anche ad avere livelli più elevati di Treponema, lo stesso patogeno riscontrato negli adulti che non vanno dal dentista da più di un anno. In altre parole, i ricercatori hanno visto un possibile legame tra l’obesità infantile e la malattia parodontale. "È stato molto interessante per me il fatto che siamo stati in grado di rilevare questi dati in una popolazione così generale, con un gruppo di persone così variabile", ha detto Burcham.
Altri dati scoperti: i microbiomi dei partecipanti più giovani, per lo più nella fascia di età compresa tra 8 e 9 anni, presentavano una maggiore diversità rispetto a quelli degli adulti.
Tuttavia, i microbiomi adulti variano maggiormente da persona a persona. I ricercatori ritengono che ciò sia dovuto al fatto che l’ambiente e la dieta degli adulti sono più ampi di quelli dei bambini.
Hanno anche visto che le persone che vivevano nella stessa famiglia condividevano microbiomi orali simili .
"Quando guardi le famiglie che vivono insieme, scopri che condividono più di quei rari taxa, i batteri che non si trovano così spesso nelle massime abbondanze", ha spiegato Burcham. Si trattava di un dato che sottolineava la rilevanza dell’ambiente costruito in relazione alle comunità microbiche nei nostri corpi.
Lavorare sullo studio della bocca è stato affascinante, anche se fuori dall’ambito normale di Burcham; Tipicamente, si concentra sullo studio dell’ecologia microbica della decomposizione.
"Penso che le nostre vite siano essenzialmente guidate dai nostri microbiomi e influenzate dai nostri microbiomi, è interessante, non importa quale sistema stiamo guardando", ha detto Burcham.
