Face à la crise du COVID-19, un dépistage précoce et efficace est nécessaire pour limiter la propagation du virus, permettant l’isolement en temps opportun des cas positifs, une action clé dans cette lutte constante. Actuellement, la plupart des tests de diagnostic du COVID-19 en cours impliquent des prélèvements nasopharyngés pour la RT-PCR, des tests d’antigène nasopharyngé au point d’intervention ou une RT-PCR de salive pour identifier l’agent pathogène. Le prélèvement nasopharyngé pour la RT-PCR est le test de référence, mais il présente l’inconvénient d’ être invasif et inconfortable (prélèvement nasopharyngé) et/ou de retard (RT-PCR) dans l’obtention du résultat.
Les composés organiques volatils (COV) ont le potentiel de devenir une approche révolutionnaire et non invasive pour le diagnostic médical chez l’homme de maladies telles que le cancer et les maladies dégénératives ou infectieuses. Aksenov a étudié les COV produits par des cultures de cellules B infectées par trois virus de la grippe : le H9N2 aviaire, le H6N2 aviaire et le H1N1 humain. Les familles de COV collectées se sont révélées uniques et spécifiques à chaque sous-type viral. Les auteurs ont conclu que des altérations mineures de l’expression du génome cellulaire induites par le virus entraînaient un changement spécifique dans la production de COV dans le métabolisme cellulaire.
Récemment, Abd El Qader a démontré la spécificité d’espèces bactériennes ou virales dans les COV produits par des cultures cellulaires infectées. Schivo a également identifié un volatilome spécifique dans les cellules des voies respiratoires infectées par un rhinovirus.
Les capacités de détection olfactive canine sont utilisées depuis des années par les forces de l’ordre pour détecter des stupéfiants ou des restes médico-légaux, des explosifs, des billets de banque, pour des missions de recherche et de sauvetage humains, et même pour localiser des mines terrestres.
Notre hypothèse , objet de notre précédente preuve de concept, reposait sur l’excrétion possible de COV spécifiques dans la sueur , induite par des actions ou des réplications cellulaires du SARS-CoV-2 générant des COV que les chiens peuvent détecter.
L’ objectif de cette étude prospective multicentrique en aveugle était de comparer la précision diagnostique de la détection de l’infection par le SRAS-CoV-2 par olfaction canine avec le standard de référence actuel (RT-PCR nasopharyngée) et deux stratégies diagnostiques alternatives (test antigénique nasopharyngé et RT salivaire). ). -PCR) dans les centres de tests communautaires.
Arrière-plan
Tout au long de la pandémie de COVID-19, tester les personnes reste une action clé. Une approche des tests rapides consiste à prendre en compte les capacités olfactives de chiens de détection dressés.
Méthodes
Étude de cohorte prospective dans deux centres communautaires de détection du COVID-19. Deux écouvillons nasopharyngés (NPS), un échantillon de salive et un échantillon de sueur ont été prélevés simultanément. Les maîtres-chiens ( et les chiens... ) étaient aveugles au statut Covid.
L’exactitude diagnostique de la détection non invasive de l’infection par le SRAS-CoV-2 par olfaction canine a été évaluée par rapport à la RT-PCR nasopharyngée comme norme de référence, à la RT-PCR salivaire et au test d’antigène nasopharyngé.
Résultats
335 adultes ambulatoires ont été inclus (143 symptomatiques et 192 asymptomatiques). Dans l’ensemble, 109/335 participants ont été testés positifs par RT-PCR nasopharyngée chez des participants symptomatiques (78/143) ou asymptomatiques (31/192).
La sensibilité globale de la détection canine était de 97 % (IC 95 % : 92 à 99) et atteignait même 100 % (IC 95 % : 89 à 100) chez les individus asymptomatiques par rapport au NPS RT-PCR.
La spécificité était de 91 % (IC à 95 %, 72 à 91), atteignant 94 % (IC à 95 %, 90 à 97) pour les individus asymptomatiques .
La sensibilité de la détection canine était supérieure à celle du test d’antigène nasopharyngé (IC 97 % : 91 à 99 versus IC 84 % : 74 à 90, p = 0,006), mais la spécificité était plus faible (IC 90 %). : 84 à 95 versus IC 97% : 93 à 99, p = 0,016).
Conclusions
La détection non invasive de l’infection par le SARS-CoV-2 par olfaction canine pourrait être une alternative à la NPS RT-PCR lorsqu’il est nécessaire d’obtenir un résultat très rapide selon les mêmes indications que les tests antigéniques dans le cadre d’un dépistage de masse.
R : Salle d’essais avec ses cônes renifleurs. B : Détail d’un cône parfumé, avec un échantillon doublement protégé et sans possibilité de contact direct avec le chien. C : Processus impliquant les cônes olfactifs et le chien. D : marquage positif par un chien, assis devant un cône contenant un échantillon positif.
Discussion
Nos résultats montrent l’ excellente sensibilité de la détection du SRAS-CoV-2 chez les chiens en utilisant la RT-PCR nasopharyngée comme référence de comparaison. Ces résultats sont cohérents avec les résultats obtenus précédemment dans des études de validation de principe utilisant la sueur chez des patients hospitalisés.
À notre connaissance, cette étude est la première menée de manière prospective dans le cadre du dépistage du SARS-CoV-2 et la première à comparer le dépistage canin et les tests antigéniques.
Les résultats détaillés n’ont pas montré de réelle différence de sensibilité observée dans les différents sous-groupes : la sensibilité est toujours supérieure à 95 % lorsque la spécificité est comprise entre 83 % et 95 %.
Les résultats obtenus par la détection canine à partir d’échantillons de sueur sont comparables à ceux des tests antigéniques nasopharyngés. Cependant, la détection canine à l’aide d’échantillons de sueur est moins invasive que les tests antigéniques sur des échantillons nasopharyngés. Ainsi, la détection de l’infection par le SARS-CoV-2 chez le chien pourrait être une alternative aux tests antigéniques.
En conclusion , les résultats obtenus dans notre étude prospective auprès de 335 personnes s’étant présentées volontairement dans l’un des centres de dépistage de l’APHP à Paris plaident en faveur du recours à l’olfaction canine comme alternative aux tests antigéniques. Les tests canins sont non invasifs et fournissent des résultats immédiats et fiables. La sensibilité globale de la détection du Covid par des chiens dressés était de 97 % et « a même atteint 100 % chez les individus asymptomatiques » par rapport au test PCR sur écouvillon nasopharyngé. Sensibilité canine globale à la CRP (IC 97 % : 91 à 99 vs IC 84 % : 74 à 90, p = 0,006), Concernant les tests antigéniques, les résultats positifs doivent être confirmés par RT-PCR, notamment pour la détection des variants. Des études supplémentaires se concentreront sur le reniflage direct des chiens afin d’évaluer les chiens renifleurs en vue de pré-tests de masse dans les aéroports, les ports, les gares, les activités culturelles ou les événements sportifs. Les tests de sueur sous les aisselles pourraient encore être utiles pour tester de petites populations ou pour des unités mobiles opérant dans des groupes locaux comme alternative aux tests antigéniques. |
