Résumé Comprendre comment le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère a apparu en 2019 est essentiel pour prévenir les épidémies zoonotiques avant qu’elles ne deviennent la prochaine pandémie. Le marché de gros des fruits de mer de Huanan, à Wuhan, en Chine, a été identifié comme une source probable de cas dans les premiers rapports, mais cette conclusion est ensuite devenue controversée. Nous montrons que les premiers cas connus de COVID-19 datant de décembre 2019, y compris ceux sans lien direct signalé, étaient géographiquement centrés sur ce marché. Nous avons signalé que des mammifères vivants sensibles au SRAS-CoV-2 avaient été vendus sur le marché fin 2019 et que, sur le marché, des échantillons environnementaux positifs au SRAS-CoV-2 étaient associés spatialement à des vendeurs vendant des mammifères vivants. Bien qu’il n’y ait pas suffisamment de preuves pour définir les événements ci-dessus et que les circonstances exactes restent obscures, nos analyses indiquent que l’émergence du SRAS-CoV-2 s’est produite via le commerce d’espèces sauvages en Chine et montrent que le marché de Huanan était l’épicentre de l’épidémie de COVID-19. pandémie. |
Analyse spatiale. (A) Encart : Carte de Wuhan, avec des points gris indiquant 1 000 échantillons aléatoires de la distribution nulle de worldpop.com. Panneau principal : la distance moyenne entre le marché de Huanan et (1) la distribution nulle de worldpop.org est indiquée par un cercle noir et (2) les cas de décembre sont indiqués par des cercles rouges (la distance jusqu’au marché de Huanan est indiquée dans des cases violettes). Point central des données de densité de population de Wuhan indiqué par un point bleu. Les points centraux des emplacements des cas de décembre sont indiqués par des points rouges (« tous les cas », « liés » et « non liés ») ; point bleu foncé (cas de la lignée A) ; et point jaune (cas de lignée B). Distance des points centraux au marché de Huanan représentée dans des cases orange. (B) Schéma montrant comment les cas peuvent être proches, mais non centrés sur un emplacement spécifique. Nous émettons l’hypothèse que si le marché de Huanan est l’épicentre de la pandémie, les premiers cas devraient non seulement en être proches de manière inattendue, mais aussi être centrés de manière inattendue sur lui (voir Méthodes). Les cas bleus montrent que les cas assez proches du marché de Huanan ne peuvent cependant pas s’y concentrer. (C) Contours de tolérance basés sur le risque relatif de cas de COVID-19 en décembre 2019 par rapport aux données de janvier à février 2020. Les points montrent les emplacements des cas de décembre. Les contours représentent la probabilité d’observer cette densité de cas de décembre dans les limites du contour donné si les cas de décembre avaient été tirés de la même distribution spatiale que les données de janvier-février.
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Une équipe internationale de 18 chercheurs, dont un scientifique de l’Université de santé de l’Utah, a déterminé que les premiers cas humains de COVID-19 sont apparus sur un marché de gros aux poissons de Wuhan, en Chine, en décembre 2019. Ils ont lié ces cas aux chauves-souris. , renards et autres mammifères vivants infectés par le virus vendus sur le marché soit pour être consommés sous forme de viande, soit pour leur fourrure.
Cette découverte, publiée dans Science , confirme les premières informations, rejetées plus tard par de hauts responsables chinois, selon lesquelles les animaux vivants vendus au marché de gros des fruits de mer de Huanan étaient probablement à l’origine de la pandémie qui a fait au moins 6,4 millions de victimes. Il existe depuis son apparition en Chine il y a près de trois ans.
"Il s’agit des études les plus convaincantes et les plus détaillées sur ce qui s’est passé à Wuhan dans les premiers stades de ce qui allait devenir la pandémie de COVID-19", déclare Stephen Goldstein, Ph.D., co-auteur de l’étude dirigée par l’auteur principal. . Kristian Anderson, Ph.D., du Scripps Research Institute de La Jolla et premier auteur Michael Worobey, Ph.D., de l’Université de l’Arizona. Goldstein est chercheur postdoctoral au département de génétique humaine de l’U of U Health. "Nous avons montré de manière convaincante que les ventes d’animaux sauvages sur le marché de Huanan à Wuhan sont impliquées dans les premiers cas humains de la maladie."
Parmi les principales conclusions de l’étude :
- L’émergence du SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, peut probablement être attribuée à un ou plusieurs des 10 à 15 étals de marché vendant des chiens, des rats, des porcs-épics, des blaireaux, des lièvres, des renards, des hérissons, des marmottes et des marmottes vivants. Muntjac chinois (un petit cerf). Les responsables de la santé et les chercheurs ont détecté le SRAS-CoV-2 dans les cages des animaux, les chariots et les grilles de drainage à ces endroits.
- Les seules zones où le virus se propageait en décembre 2019 étaient les quartiers situés à moins d’un demi-mile du marché. Auparavant, certains chercheurs avaient suggéré que le virus avait été introduit sur le marché depuis une autre partie de la ville et s’était propagé parmi ses clients. Au lieu de cela, les nouvelles découvertes suggèrent fortement que le virus est apparu sur le marché via la vente d’animaux vivants et s’est lentement propagé de là aux quartiers voisins, puis à la ville dans son ensemble.
- Deux variantes du virus SARS-CoV-2 ont été détectées sur le marché. Cela suggère que les deux variantes sont originaires indépendamment du marché et contribue à confirmer l’hypothèse des chercheurs selon laquelle la propagation précoce de l’infection a commencé là-bas. Si le virus est originaire d’ailleurs, il est plus probable qu’une seule variante ait été trouvée.
À l’avenir, les chercheurs affirment que les responsables publics devraient chercher à mieux comprendre le commerce des espèces sauvages en Chine et ailleurs et promouvoir des tests plus approfondis sur les animaux vivants vendus sur les marchés afin de réduire le risque de futures pandémies.
Discussion
Plusieurs éléments de preuve soutiennent l’hypothèse selon laquelle le marché de Huanan aurait été l’épicentre de la pandémie de COVID-19 et que le SRAS-CoV-2 serait issu d’activités associées au commerce d’animaux sauvages vivants. Les analyses spatiales au sein du marché montrent que les échantillons environnementaux positifs au SRAS-CoV-2, notamment les cages, les chariots et les congélateurs, étaient associés à des activités concentrées dans le coin sud-ouest du marché. Il s’agit de la même section où les vendeurs vendaient des mammifères vivants, notamment des chiens viverrins, des blaireaux porcins et des renards roux, juste avant la pandémie de COVID-19.
Plusieurs échantillons positifs ont été prélevés sur un stand connu pour avoir vendu des mammifères vivants, et l’évacuation d’eau à côté de ce stand, ainsi que d’autres égouts et un stand d’animaux sauvages à proximité du côté sud-ouest du marché, ont été testés positifs pour le SRAS-CoV -2. . Ces résultats suggèrent que des animaux infectés étaient présents sur le marché de Huanan au début de la pandémie de COVID-19 ; cependant, nous n’avons pas accès à des échantillons d’animaux vivants des espèces concernées. Des informations supplémentaires, notamment des données de séquençage et une stratégie d’échantillonnage détaillée, seraient inestimables pour tester de manière exhaustive cette hypothèse.