Résumé La recherche de diagnostics, de vaccins et de traitements potentiels basés sur les anticorps pour le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère pandémique s’est concentrée presque exclusivement sur les protéines de pointe (S) et de nucléocapside (N). Les protéines membranaires (M) du coronavirus, ORF3a et ORF8, sont des immunogènes humoraux dans d’autres coronavirus (CoV), mais restent largement non étudiées pour le SRAS-CoV-2. Ici, nous utilisons une cartographie par micropuce peptidique ultradense pour montrer que l’infection par le SRAS-CoV-2 induit des réponses anticorps robustes contre les épitopes dans l’ensemble du protéome du SRAS-CoV-2, en particulier dans M, dans lequel 1 épitope a atteint une excellente précision diagnostique. Nous avons cartographié 79 épitopes de cellules B à travers le protéome du SRAS-CoV-2 et démontré que les anticorps qui se développent en réponse à l’infection par le SRAS-CoV-2 se lient à des séquences peptidiques homologues dans les 6 autres CoV humains connus. Nous avons également confirmé la réactivité contre 4 de nos épitopes de premier plan à l’aide d’un test immuno-enzymatique (ELISA). La gravité de la maladie était corrélée à une réactivité accrue à 9 épitopes du SRAS-CoV-2 dans S, M, N et ORF3a dans notre population. Nos résultats démontrent des épitopes de cellules B hautement réactifs jusqu’alors inconnus dans tout le protéome du SRAS-CoV-2 et d’autres protéines CoV. |
Tous les coronavirus produisent quatre protéines structurelles primaires et plusieurs protéines non structurelles. Cependant, la plupart des recherches basées sur les anticorps sur le SRAS-CoV-2 se sont concentrées sur la nucléocapside et les protéines de pointe. Une étude publiée dans PLOS Biology par Anna Heffron, Irene Ong et leurs collègues de l’Université du Wisconsin-Madison, aux États-Unis, suggère que des réponses immunitaires pourraient se développer contre d’autres protéines produites par le virus SARS-CoV-2.
L’efficacité des vaccins à base de protéines de pointe est variable et toutes les personnes infectées par le SRAS-CoV-2 ne produisent pas d’anticorps détectables contre les protéines de pointe ou de nucléocapside. Par conséquent, les options élargies basées sur les anticorps ont le potentiel de jouer un rôle important dans l’amélioration des vaccins, des diagnostics et des traitements, compte tenu notamment de l’émergence de nouveaux variants.
Pour vérifier si l’infection par le SRAS-CoV-2 induit de fortes réponses anticorps contre toutes les protéines du SRAS-CoV-2, les chercheurs ont cartographié 79 « épitopes », des régions spécifiques du protéome viral que les anticorps reconnaissent et auxquelles ils se lient. Ils ont également vérifié si les anticorps qui se développent en réponse au SRAS-CoV-2 ou les anticorps existants provenant d’expositions antérieures au coronavirus pourraient se lier à l’une des protéines des six autres coronavirus humains connus pour identifier d’éventuels épitopes à réaction croisée.
En plus des protéines de pointe et de nucléocapside, les auteurs ont localisé des épitopes de cellules B hautement réactifs jusqu’alors inconnus dans toute la gamme de protéines du SRAS-CoV-2 et d’autres coronavirus, élargissant ainsi le potentiel de développement futur de vaccins et de produits thérapeutiques. Cependant, des recherches futures sont nécessaires pour déterminer combien de temps ces anticorps restent et si les réponses des personnes vaccinées diffèrent de celles qui ont contracté le COVID-19 avant la vaccination. Le Dr Ong et ses collègues continueront d’étudier ces problèmes chez les adultes et les enfants.
Bien que les auteurs n’aient pas directement profilé les variantes préoccupantes apparues depuis le début de la pandémie de COVID-19, une comparaison du génome original du SRAS-CoV-2 avec certaines des variantes préoccupantes a identifié de nombreuses variations dans les régions qui sont en dans les 3 acides aminés des épitopes de liaison aux anticorps identifiés.
Selon les auteurs, « notre large profil de réactivité des anticorps à résolution au niveau des épitopes chez les sujets convalescents atteints du COVID-19, confirmé par des tests indépendants, fournit de nouveaux épitopes qui pourraient servir de cibles importantes dans le développement de diagnostics, de vaccins et de traitements améliorés ». contre le SRAS-CoV-2, les variantes préoccupantes et les coronavirus humains dangereux qui pourraient apparaître à l’avenir.
