Les données les plus importantes mettent en évidence les points suivants :
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Aucun nouveau variant du COVID-19 n’est apparu en Chine lors de la récente flambée des infections depuis que le pays a mis fin à sa politique zéro COVID, selon une analyse des cas réalisée à Pékin.
L’étude, publiée dans The Lancet , suggère que deux sous-variantes d’Omicron existantes, BA.5.2 et BF.7, parmi les variantes les plus dominantes à Pékin en 2022, représentaient plus de 90 % des infections locales entre le 14 novembre et le 20 décembre 2022. .
Les auteurs affirment que les résultats représentent un instantané de la pandémie en Chine, en raison des caractéristiques de la population de Pékin et de la circulation de souches hautement transmissibles du COVID-19.
Il est largement rapporté que la Chine a mis fin à sa stratégie zéro Covid le 7 décembre 2022. Depuis la levée de ces politiques strictes de contrôle du COVID-19, qui comprenaient des confinements ciblés, des tests de masse et une quarantaine, le nombre croissant de cas a fait craindre que de nouveaux cas ne surviennent. des variantes pourraient apparaître. . Au cours des trois années qui se sont écoulées depuis que le COVID-19 a été déclaré pandémie mondiale, l’émergence de variantes telles que Alpha, Beta, Gamma, Delta et Omicron a provoqué de multiples vagues de cas dans le monde.
Depuis décembre 2019, les auteurs de l’étude ont régulièrement collecté des échantillons respiratoires provenant de cas de COVID-19 importés et locaux à Pékin, et ont sélectionné au hasard des échantillons pour analyse. Aucune transmission locale persistante n’a été signalée à Pékin avant décembre 2022.
Dans cette dernière étude, les auteurs ont analysé des échantillons de COVID-19 détectés à Pékin en 2022. Les séquences du génome ont été générées à l’aide d’une technologie de séquençage rapide à grande échelle, et leur histoire évolutive et leur dynamique de population ont été analysées à l’aide de séquences de COVID-19. haute qualité existante.
Sur un total de 2 881 séquences de haute qualité incluses dans l’étude, 413 nouveaux échantillons ont été sélectionnés et séquencés au hasard entre le 14 novembre – lorsque les infections ont commencé à augmenter considérablement – et le 20 décembre 2022. Parmi eux, 350 étaient des cas locaux et 63 importés. Les cas importés provenaient de 63 pays et régions.
L’analyse des 413 nouvelles séquences a révélé qu’elles appartiennent toutes à des souches connues et existantes de COVID-19. La souche dominante à Pékin après le 14 novembre 2022 était la BF.7, qui représentait 75,7 % des infections locales. Une autre sous-variante d’Omicron, BA5.2, était responsable de 16,3 % des cas locaux.
Les populations de BA5.2 et BF.7 à Pékin ont augmenté après le 14 novembre 2022. La taille effective de la population de BA.5.2 n’a pas sensiblement changé entre le 14 et le 25 novembre 2022, mais a considérablement augmenté autour du 30 novembre 2022. L’augmentation a coïncidé avec une augmentation du nombre d’infections BA.5.2 vers le 30 novembre 2022. La population BF.7 a progressivement augmenté depuis le 14 novembre 2022.
L’auteur principal, le professeur George Gao, de l’Institut de microbiologie de l’Académie chinoise des sciences, a déclaré : « Étant donné l’impact des variantes sur l’évolution de la pandémie, il était important de déterminer si de nouvelles sont apparues après les récents changements. Politiques de prévention et de contrôle du COVID-19. Notre analyse suggère que deux sous-variantes connues d’Omicron, plutôt que de nouvelles variantes, ont été principalement responsables de la flambée actuelle à Pékin et probablement dans l’ensemble de la Chine, « avec la circulation continue à grande échelle ». de COVID-19 en Chine, il est important que nous continuions à surveiller la situation de près afin que tout nouveau variant susceptible d’émerger soit détecté le plus rapidement possible.
Les auteurs reconnaissent certaines limites de leur étude. Bien que les données n’aient été analysées qu’à Pékin en 2022, plutôt qu’en Chine continentale, les auteurs affirment qu’elles sont représentatives du pays dans son ensemble. Le nombre de cas de COVID-19 confirmés en laboratoire en décembre 2022 n’était pas disponible car les tests obligatoires à grande échelle ont pris fin, ce qui suggère que le nombre réel d’infections est sous-estimé, conduisant à un certain degré de biais d’échantillonnage dans l’étude. base de données. Davantage d’échantillonnage est nécessaire pour étudier la transmissibilité et la pathogénicité des sous-variantes d’Omicron. Le taux d’évolution du virus a été supposé constant au cours de la phase initiale de l’épidémie, même s’il est possible qu’il varie en fonction du variant.
Écrivant dans un commentaire lié, le professeur Wolfgang Preiser et le Dr Tongai Matenga de l’Université de Stellenbosch, en Afrique du Sud, qui n’ont pas participé à l’étude, ont déclaré : « Il est bienvenu de voir ces données indispensables en provenance de Chine. "Il est certes rassurant que cette étude n’ait révélé aucune preuve de nouveaux variants, mais ce n’est pas une surprise : l’augmentation s’explique en grande partie par l’arrêt brutal des mesures de contrôle efficaces." Ils appellent toutefois à la prudence avant de tirer des conclusions sur la Chine dans son ensemble. sur les données de Pékin, déclarant : « Le profil épidémiologique moléculaire du SRAS-CoV-2 dans une région d’un vaste pays densément peuplé ne peut pas être extrapolé à l’ensemble du pays. » . "Dans d’autres régions de Chine, d’autres dynamiques évolutives pourraient se développer, incluant éventuellement des espèces animales qui pourraient être infectées par des humains et "propager" un virus plus évolué."
