Prédiction à long terme du COVID : aperçus de la biologie des systèmes

Une étude menée par l'Institute for Systems Biology identifie plusieurs facteurs d'avertissement pour le long COVID, fournissant des informations sur les mécanismes biologiques sous-jacents et éclairant les modèles prédictifs pour identifier les personnes présentant un risque accru de symptômes persistants après une infection par le SRAS-CoV-2.

Septembre 2022
Prédiction à long terme du COVID : aperçus de la biologie des systèmes
Source:  Cell

Prédiction du long COVID au point initial du diagnostic du COVID-19

Une partie importante des personnes qui contractent le virus SARS-CoV-2 (certaines estimations suggèrent que plus de 40 %) souffrent d’effets chroniques connus sous le nom de séquelles post-aiguës du COVID-19 (PASC), communément appelées COVID long .

Les symptômes du PASC comprennent la fatigue, le brouillard cérébral, la perte du goût et de l’odorat, des difficultés respiratoires, etc.

Aujourd’hui, les chercheurs ont identifié plusieurs facteurs qui peuvent être mesurés dès le point initial du diagnostic du COVID-19 et qui permettent d’anticiper si un patient est susceptible de développer un long COVID. Ces « facteurs PASC » sont la présence de certains auto-anticorps, un diabète de type 2 préexistant, les taux d’ARN du SRAS-CoV-2 dans le sang et les taux d’ADN du virus Epstein-Barr dans le sang.

« L’identification de ces facteurs PASC est un grand pas en avant non seulement pour comprendre le long COVID et potentiellement le traiter, mais également pour déterminer quels patients sont les plus à risque de développer des maladies chroniques », a déclaré le président de l’ISB, le Dr Jim Heath, auteur co-correspondant. d’un travail de recherche qui sera publié par la revue Cell. « Ces résultats nous aident également à cadrer notre réflexion sur d’autres maladies chroniques, comme le syndrome de Lyme post-aigu, par exemple. »

De plus, les chercheurs ont découvert que les cas légers de COVID-19, et pas seulement les cas graves, sont associés à un long COVID. Ils suggèrent également que l’administration d’antiviraux très tôt au cours de la maladie peut potentiellement prévenir certains PASC.

"Le long COVID provoque une morbidité importante chez les survivants du COVID-19, mais la pathobiologie n’est pas bien comprise", a déclaré le Dr Jason Goldman, co-auteur de l’article et expert en maladies infectieuses. « Notre étude combine des données cliniques et des résultats rapportés par les patients avec des analyses multi-omiques approfondies pour découvrir les associations biologiques importantes qui se produisent chez les patients atteints de PASC. Certaines découvertes, telles qu’un faible taux de cortisol chez les patients atteints de longue durée de COVID, ont le potentiel de se traduire rapidement en clinique. «Nos résultats constituent une base importante pour le développement de thérapies permettant de traiter le long COVID.»

Les chercheurs ont collecté des échantillons de sang et des écouvillons auprès de 309 patients atteints de COVID-19 à différents moments pour effectuer un phénotypage complet qui a été intégré aux données cliniques et aux symptômes signalés par les patients afin de mener une enquête multiomique longitudinale approfondie.

Une découverte clé de l’étude concerne la charge virale , qui peut être mesurée à proximité du diagnostic pour prédire les symptômes prolongés du COVID. "Nous avons constaté que les premières mesures virales sanguines sont fortement associées à certains symptômes longs du COVID que les patients développeront des mois plus tard", a déclaré le Dr Yapeng Su, co-auteur principal et co-auteur correspondant de l’article.

De plus, les chercheurs ont découvert que le virus Epstein-Barr (EBV), un virus qui infecte 90 pour cent de la population humaine et qui est normalement dormant dans l’organisme après l’infection, se réactive peu de temps après l’infection par le SRAS. CoV-2, qui est significativement associé aux futurs symptômes longs du COVID. "Cela peut être lié à une dérégulation immunitaire lors de l’infection au COVID-19", a ajouté Su.

L’équipe a également découvert que les auto-anticorps (qui sont associés à des maladies auto-immunes telles que le lupus) anticipent le PASC au moment du diagnostic et qu’à mesure que les auto-anticorps augmentent, les anticorps protecteurs contre le SRAS-CoV-2 diminuent. Cela suggère une relation entre le COVID long, les auto-anticorps et les patients à haut risque de réinfection.

"De nombreux patients présentant un taux élevé d’auto-anticorps ont simultanément de faibles anticorps (protecteurs) qui neutralisent le SRAS-CoV-2, ce qui les rendra plus sensibles aux infections émergentes", a déclaré Daniel Chen, co-auteur de l’article.

Le projet de recherche était une collaboration entre l’ISB, Providence, l’Université suédoise de Washington, le Fred Hutchinson Cancer Research Center, Stanford, UCLA, UCSF et d’autres.