Le descendant d’Omicron EG.5 est le dernier à être qualifié de « variante préoccupante » par l’Organisation mondiale de la santé (OMS), rejoignant les rangs actuels de XBB.1.16 et XBB.1.5. La nouvelle désignation, faite dans le cadre d’une première évaluation des risques du variant le 9 août, reflète son « augmentation notable » de la prévalence mondiale au cours des dernières semaines.
Le rapport intervient alors que les États-Unis connaissent une augmentation des hospitalisations et des décès et que l’attente grandit pour les vaccins mis à jour , qui devraient être disponibles cet automne. Le variant EG.5 pourrait contribuer à une augmentation des cas, note le rapport, même s’il n’existe à ce jour aucune preuve qu’il provoque une maladie plus grave.
Pour l’instant, conclut le rapport, la nouvelle variante ne semble pas représenter un plus grand risque pour la santé publique que les autres qui circulent. Cela dit, il prévient qu’actuellement, la surveillance des variantes n’est pas représentative et que les rapports sur les variantes ne sont pas fiables . Ces facteurs créent des lacunes dans les données, un obstacle à une évaluation complète des risques liés aux EG.5.
Voici ce que l’on sait actuellement sur ce variant et comment il pourrait façonner la situation du COVID-19 dans les mois à venir.
A un avantage de croissance
L’évaluation des risques de l’OMS a déterminé que l’EG.5 présente un avantage de croissance modéré. La variante a été signalée pour la première fois à l’OMS en février, et son pourcentage de séquences signalées n’a cessé d’augmenter depuis lors. Sa prévalence mondiale a plus que doublé cet été, passant d’environ 8 % au cours de la semaine se terminant le 25 juin à environ 17 % au cours de la semaine se terminant le 23 juillet.
Au moment de la publication, ce chiffre n’était pas encore en hausse à l’échelle mondiale, selon les données disponibles les plus récentes. Une mise à jour épidémiologique de l’OMS du 10 août a noté que XBB.1.16 était la variante la plus répandue dans le monde au cours de la semaine se terminant le 23 juillet, représentant un quart des séquences virales. XBB.1.5 était en déclin, représentant environ 13 % des séquences.
Mais EG.5.1, une sous-variante qui représente la majorité des séquences EG.5, a un nombre de reproduction effectif plus élevé que ces variantes XBB, selon une étude publiée sur le serveur de prépublication bioRxiv, qui n’a pas encore été examinée par ses pairs. Cette découverte suggère que EG.5 et ses sous-lignées pourraient prédominer « dans un avenir proche », a écrit le virologue Kei Sato, PhD, auteur principal de l’étude et professeur à l’Institut des sciences médicales de l’Université de Tokyo au Japon, dans un article. . e-mail à JAMA.
EG.5 est déjà la variante qui connaît la croissance la plus rapide dans plusieurs régions du monde. Aux États-Unis, ce virus et ses sous-lignées ont probablement dépassé XBB.1.16 et XBB.1.5 début août, selon les projections des Centers for Disease Control and Prevention (CDC).
Possède des propriétés d’échappement des anticorps
EG.5 descend de XBB.1.9.2, une progéniture d’Omicron avec la même protéine de pointe que XBB.1.5, la variante ciblée par les prochains vaccins. Mais contrairement à ces variantes, EG.5 possède la mutation de la protéine Spike F456L, qui, lors d’expériences en laboratoire, lui a permis d’échapper à la plupart des anticorps neutralisants XBB.1.5. La sous-variante EG.5.1, qui représente 88 % des séquences EG.5 disponibles, contient une mutation supplémentaire de la protéine Spike, Q52H.
La mutation F456L semble être particulièrement importante, ont déclaré Sato et d’autres. "Le F456L en particulier est apparu à plusieurs reprises chez les descendants de XBB.1.5 et pourrait le rendre légèrement moins sensible aux anticorps chez les personnes précédemment vaccinées et/ou infectées", Nicole Doria-Rose, PhD, scientifique aux National Institutes of Health ( NIH) a déclaré dans un e-mail. Le F456L peut également être lié à la transmissibilité, a déclaré Doria-Rose, responsable du noyau d’immunologie humorale au Centre de recherche sur les vaccins de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses.
Sur la base des données actuelles, l’OMS a classé le risque de fuite d’anticorps de l’EG.5 comme modéré . Le rapport prévient cependant que les résultats de l’évasion immunitaire sont basés sur des études en laboratoire unique utilisant des virus pseudotypés et non de type sauvage, et que des expériences supplémentaires sont nécessaires pour évaluer davantage dans quelle mesure EG.5 contrecarre le virus. anticorps existants.
On ne sait pas si c’est lui qui alimente la vague de COVID
Aux États-Unis, la positivité des tests COVID-19, les niveaux d’eaux usées, les visites aux services d’urgence, les hospitalisations et les décès sont en augmentation , selon les données du CDC jusqu’à la première semaine d’août. Cependant, on ne sait pas exactement dans quelle mesure l’EG.5 pourrait être à l’origine de la vague actuelle. Sato a déclaré que la diminution de l’immunité due aux vaccins et aux infections antérieures pourrait y contribuer.
Il est également important de noter que les hospitalisations et les décès aux États-Unis restent considérablement inférieurs à la même période de l’année dernière. Carlos del Rio, MD, professeur distingué de médecine à la Division des maladies infectieuses de la faculté de médecine de l’Université Emory et président de l’Infectious Diseases Society of America, s’est dit "quelque peu préoccupé" par l’augmentation actuelle des hospitalisations, qu’il attribue principalement aux variantes XBB. "Cependant", a-t-il écrit dans un e-mail, "je sais aussi que si les gens reçoivent un rappel , il est très peu probable qu’ils finissent par être hospitalisés lorsqu’ils sont infectés."
Rien n’indique que ce soit plus grave
Jusqu’à présent, aucun cas d’EG.5 provoquant des cas plus graves de COVID-19 n’a été signalé, ce qui a incité l’OMS à classer son niveau de risque de maladie grave comme faible .
"Plusieurs pays avec une prévalence croissante de l’EG.5 ont connu une augmentation des cas et des hospitalisations, bien qu’il n’y ait actuellement aucune preuve d’une augmentation de la gravité de la maladie directement associée à l’EG.5", note le rapport.
Doria-Rose a expliqué que l’EG.5 pourrait être lié à l’augmentation actuelle des cas de COVID-19 et donc des hospitalisations, « en fonction de sa transmissibilité et non de sa gravité ».
Cependant, l’évaluation des risques de l’OMS contient des avertissements. Les rapports mondiaux sur les nouvelles hospitalisations et les admissions dans les unités de soins intensifs ont considérablement diminué, c’est pourquoi l’OMS a déclaré qu’il était préférable d’être prudent dans l’interprétation des données sur les cas graves. Et il a déclaré que davantage d’études étaient nécessaires pour étudier l’effet de la variante sur les résultats cliniques.
Il y a de l’optimisme quant à la mise à jour du rappel de vaccin
Les vaccins COVID-19 mis à jour devraient être disponibles aux États-Unis entre la mi-septembre et la fin septembre, à condition qu’ils reçoivent l’autorisation de la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis et qu’ils soient recommandés par le CDC, a déclaré un porte-parole de la FDA dans un courrier électronique à JAMA. La grande question est : seront-ils efficaces contre EG.5 ?
Del Rio et Doria-Rose ont déclaré qu’ils pensaient que les amplificateurs monovalents XBB.1.5 offriraient une certaine protection contre EG.5, qui est après tout une branche de XBB. (Également connu sous le nom de XBB.1.9.2.5).
"Étant donné qu’il y a très peu de changements concernant la protéine de pointe XBB.1.5, qui est à la base des vaccins pour l’automne 2023, je m’attendrais à ce que les nouveaux vaccins fonctionnent bien contre elle, et mieux que les vaccins de l’année dernière. basé sur des vaccins ancestraux et des souches BA.5 », a déclaré Doria-Rose.
David C. Montefiori, PhD, qui dirige le laboratoire de recherche et de développement de vaccins contre le VIH et la COVID-19 au Duke University Medical Center, a fait écho à cela dans un e-mail. "Les vaccins d’automne devraient continuer à être très efficaces contre l’EG.5", a-t-il déclaré, ajoutant que la mutation F456L "ne devrait pas avoir un impact majeur sur la capacité du variant à échapper au vaccin".
La confirmation pourrait arriver prochainement. Montefiori a déclaré que son équipe et d’autres chercheurs analysaient des échantillons de sérum provenant de personnes ayant reçu le vaccin mis à jour.
En mai de cette année, seulement 17 % des Américains avaient reçu le rappel bivalent initial. Pour ceux qui ont sauté une dose de rappel, del Río a déclaré à ce stade qu’il recommande d’attendre environ un mois jusqu’à ce que des vaccins mis à jour soient disponibles . Son message : « Le COVID n’est pas terminé. Obtenez vos renforts dès que possible . »
